MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia solanacearum GMI1000 chromosome

Total Repeats: 91473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003295	CAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17544720
2	NC_003295	GCCGT	2	10	565	574	0 %	20 %	40 %	40 %	17544720
3	NC_003295	ACGC	2	8	580	587	25 %	0 %	25 %	50 %	17544720
4	NC_003295	TTTGC	2	10	745	754	0 %	60 %	20 %	20 %	17544721
5	NC_003295	GC	3	6	814	819	0 %	0 %	50 %	50 %	17544721
6	NC_003295	AAG	2	6	838	843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17544721
7	NC_003295	CG	3	6	962	967	0 %	0 %	50 %	50 %	17544721
8	NC_003295	GCC	2	6	985	990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544721
9	NC_003295	GC	3	6	1039	1044	0 %	0 %	50 %	50 %	17544721
10	NC_003295	TGCCC	2	10	1064	1073	0 %	20 %	20 %	60 %	17544721
11	NC_003295	GCC	2	6	1075	1080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544721
12	NC_003295	CG	3	6	1114	1119	0 %	0 %	50 %	50 %	17544722
13	NC_003295	TGC	2	6	1120	1125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544722
14	NC_003295	CTG	2	6	1131	1136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544722
15	NC_003295	TCG	2	6	1165	1170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544722
16	NC_003295	GC	3	6	1171	1176	0 %	0 %	50 %	50 %	17544722
17	NC_003295	CG	4	8	1208	1215	0 %	0 %	50 %	50 %	17544722
18	NC_003295	GCC	2	6	1313	1318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544722
19	NC_003295	CGC	2	6	1319	1324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544722
20	NC_003295	CGCTG	2	10	1331	1340	0 %	20 %	40 %	40 %	17544722
21	NC_003295	GAC	2	6	1367	1372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544722
22	NC_003295	CG	3	6	1391	1396	0 %	0 %	50 %	50 %	17544722
23	NC_003295	TCT	2	6	1462	1467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17544723
24	NC_003295	CTG	2	6	1482	1487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544723
25	NC_003295	CG	3	6	1503	1508	0 %	0 %	50 %	50 %	17544723
26	NC_003295	CCA	2	6	1514	1519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17544723
27	NC_003295	TTC	2	6	1527	1532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17544723
28	NC_003295	CGC	2	6	1537	1542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544723
29	NC_003295	CAC	2	6	1550	1555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17544723
30	NC_003295	CCG	3	9	1558	1566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544723
31	NC_003295	GCC	2	6	1602	1607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544723
32	NC_003295	GCCG	2	8	1610	1617	0 %	0 %	50 %	50 %	17544723
33	NC_003295	CCG	3	9	1615	1623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544723
34	NC_003295	GGC	2	6	1631	1636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544723
35	NC_003295	TCG	2	6	1681	1686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544723
36	NC_003295	ACG	2	6	1689	1694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544723
37	NC_003295	GCT	2	6	1748	1753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544723
38	NC_003295	ACG	2	6	1768	1773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544723
39	NC_003295	GC	3	6	1821	1826	0 %	0 %	50 %	50 %	17544723
40	NC_003295	CGG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544723
41	NC_003295	ACCAC	2	10	1855	1864	40 %	0 %	0 %	60 %	17544723
42	NC_003295	CCG	2	6	1879	1884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544723
43	NC_003295	CGG	2	6	1904	1909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544723
44	NC_003295	CGCTCA	2	12	1918	1929	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	17544723
45	NC_003295	CCG	2	6	1930	1935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544723
46	NC_003295	GCG	2	6	1942	1947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544723
47	NC_003295	ACG	2	6	2017	2022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544723
48	NC_003295	GC	3	6	2061	2066	0 %	0 %	50 %	50 %	17544723
49	NC_003295	CGG	2	6	2069	2074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544723
50	NC_003295	ACACCG	2	12	2125	2136	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	17544723
51	NC_003295	CGAC	2	8	2197	2204	25 %	0 %	25 %	50 %	17544723
52	NC_003295	GCA	2	6	2225	2230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544723
53	NC_003295	CGG	2	6	2254	2259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544723
54	NC_003295	GCA	2	6	2321	2326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544723
55	NC_003295	GGCT	2	8	2448	2455	0 %	25 %	50 %	25 %	17544723
56	NC_003295	CAT	2	6	2459	2464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17544723
57	NC_003295	GCT	2	6	2483	2488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544723
58	NC_003295	GCT	2	6	2504	2509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544723
59	NC_003295	TTC	2	6	2562	2567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17544723
60	NC_003295	CCA	2	6	2578	2583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17544723
61	NC_003295	AGA	2	6	2662	2667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17544723
62	NC_003295	GAT	2	6	2678	2683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17544723
63	NC_003295	CGG	2	6	2717	2722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544723
64	NC_003295	CTGC	2	8	2723	2730	0 %	25 %	25 %	50 %	17544723
65	NC_003295	TGC	2	6	2773	2778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544723
66	NC_003295	GTC	2	6	2780	2785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544723
67	NC_003295	GCGCG	2	10	2795	2804	0 %	0 %	60 %	40 %	17544723
68	NC_003295	GGCTG	2	10	2809	2818	0 %	20 %	60 %	20 %	17544723
69	NC_003295	CCG	2	6	2910	2915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544723
70	NC_003295	GAT	3	9	2933	2941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17544723
71	NC_003295	TTC	4	12	2970	2981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17544723
72	NC_003295	CCGG	2	8	2982	2989	0 %	0 %	50 %	50 %	17544723
73	NC_003295	CAA	2	6	3011	3016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17544723
74	NC_003295	GCA	2	6	3032	3037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544723
75	NC_003295	AAG	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17544723
76	NC_003295	GCC	2	6	3081	3086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544723
77	NC_003295	GCG	2	6	3325	3330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544724
78	NC_003295	CGT	2	6	3338	3343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544724
79	NC_003295	GC	3	6	3365	3370	0 %	0 %	50 %	50 %	17544724
80	NC_003295	GCC	2	6	3401	3406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544724
81	NC_003295	ACCT	2	8	3417	3424	25 %	25 %	0 %	50 %	17544724
82	NC_003295	CGG	2	6	3530	3535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544724
83	NC_003295	GGT	2	6	3539	3544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544724
84	NC_003295	GCT	3	9	3551	3559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544724
85	NC_003295	CTGC	2	8	3566	3573	0 %	25 %	25 %	50 %	17544724
86	NC_003295	GGCC	2	8	3575	3582	0 %	0 %	50 %	50 %	17544724
87	NC_003295	CGCGC	2	10	3622	3631	0 %	0 %	40 %	60 %	17544724
88	NC_003295	GCC	2	6	3702	3707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544724
89	NC_003295	GC	3	6	3708	3713	0 %	0 %	50 %	50 %	17544724
90	NC_003295	CG	3	6	3719	3724	0 %	0 %	50 %	50 %	17544724
91	NC_003295	TGG	2	6	3793	3798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544724
92	NC_003295	GAG	2	6	3819	3824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17544724
93	NC_003295	GCC	2	6	3843	3848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544724
94	NC_003295	CG	4	8	3851	3858	0 %	0 %	50 %	50 %	17544724
95	NC_003295	GC	3	6	3906	3911	0 %	0 %	50 %	50 %	17544724
96	NC_003295	GCT	2	6	3920	3925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544724
97	NC_003295	GTG	2	6	3942	3947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544724
98	NC_003295	GTC	2	6	3974	3979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544724
99	NC_003295	CAC	2	6	4034	4039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17544724
100	NC_003295	GCA	2	6	4052	4057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544724
101	NC_003295	TCG	2	6	4090	4095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544724
102	NC_003295	CCG	2	6	4099	4104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544724
103	NC_003295	GCATCG	2	12	4135	4146	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	17544724
104	NC_003295	GCC	2	6	4158	4163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544724
105	NC_003295	CGT	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544724
106	NC_003295	CTG	2	6	4191	4196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544724
107	NC_003295	CCG	2	6	4228	4233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544724
108	NC_003295	GCC	2	6	4239	4244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544724
109	NC_003295	GCC	2	6	4271	4276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544724
110	NC_003295	TCA	2	6	4297	4302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17544724
111	NC_003295	GGCG	2	8	4316	4323	0 %	0 %	75 %	25 %	17544724
112	NC_003295	GC	3	6	4374	4379	0 %	0 %	50 %	50 %	17544724
113	NC_003295	TGC	2	6	4399	4404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544724
114	NC_003295	GCG	2	6	4407	4412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544724
115	NC_003295	CTG	2	6	4413	4418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544724
116	NC_003295	GGC	3	9	4437	4445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544724
117	NC_003295	GC	3	6	4461	4466	0 %	0 %	50 %	50 %	17544724
118	NC_003295	GCGCT	2	10	4482	4491	0 %	20 %	40 %	40 %	17544724
119	NC_003295	CGC	2	6	4514	4519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544724
120	NC_003295	TGA	2	6	4619	4624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17544724
121	NC_003295	TTG	2	6	4626	4631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17544724
122	NC_003295	AGT	2	6	4663	4668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17544724
123	NC_003295	CCG	2	6	4936	4941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544725
124	NC_003295	GTC	2	6	4985	4990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544725
125	NC_003295	CGA	2	6	5005	5010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544725
126	NC_003295	TGG	2	6	5212	5217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544726
127	NC_003295	GCC	2	6	5233	5238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544726
128	NC_003295	GGCTG	2	10	5260	5269	0 %	20 %	60 %	20 %	17544726
129	NC_003295	CGC	2	6	5274	5279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544726
130	NC_003295	GCC	2	6	5300	5305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544726
131	NC_003295	CGC	2	6	5317	5322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544726
132	NC_003295	GCT	2	6	5355	5360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544726
133	NC_003295	GGA	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17544726
134	NC_003295	CGC	2	6	5450	5455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544726
135	NC_003295	TGC	2	6	5462	5467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544726
136	NC_003295	TTTCG	2	10	5478	5487	0 %	60 %	20 %	20 %	17544726
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394	NC_003295	TGGC	2	8	15330	15337	0 %	25 %	50 %	25 %	17544733
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398	NC_003295	GGA	2	6	15485	15490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17544733
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